| 1 | Gene 2013 8月525日：107-15 |
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| PMID | 23644028 |
| 标题 | 精神分裂症全基因组关联研究的途径分析。 |
| 抽象的 | 这项研究的目的是确定候选单核苷酸多态性（SNP）和有助于候选机制精神分裂症敏感性并使用基于分析途径的方法生成基因至途径假设的基因。 我们用了精神分裂症1378个对照组中660,259个SNP的基因型的GWAS数据和质量控制过滤后的1351例欧洲下降病例。将ICSNPathway（识别候选因果SNP和途径）应用于精神分裂症GWAS数据集。第一阶段涉及通过连锁不平衡分析和发现最重要的SNP的功能性SNP注释对候选SNP进行预选。第二阶段涉及使用改进的基因集富集分析的预选候选SNP的生物学机制注释。 ICSNPathway分析确定了15个候选SNP，十个候选途径和九种假设的生物学机制。最密切相关的潜在途径如下。首先，rs1644731和rs1644730至RDH8至雌激素生物合成过程（P <0.001，FDR <0.001）。该途径涉及的基因为RDH8和HSD3B1（p <0.05）。全反元素脱氢酶（RDH8）是一种视觉循环酶，在NADPH存在的情况下可将全反送替代元素降低为全反元素。涉及的化学反应和途径导致雌激素的形成，雌激素是C18类固醇激素，可以刺激女性性特征的发展。其次，rs1146031至ACVR1至中胚层形成和激活素结合（P <0.001，FDR = 0.032，0.034）。15个候选基因中有两个是已知的基因精神分裂症：KCNQ2和APOL2。已知雌激素生物合成过程中的10种候选途径之一与精神分裂症（p <0.001，fdr <0.001）。但是，候选基因的13个（RDH8，ACVR1，PSMD9，KCNAB1，SLC17A3，ARCN1，COG7，stab2，LRPAP1，Stab1，CXCL16，COL4A4，EXOSC3）和9个候选途径是新颖的。 通过将ICSNPathway分析应用于精神分裂症GWAS数据，我们确定了候选SNP，KCNQ2和APOL2等候选基因以及涉及雌激素生物合成过程的途径可能有助于精神分裂症敏感性。需要进一步分析以验证该分析的结果。 |
| SCZ关键字 | 精神分裂症 |