1 FEBS Open Bio 2014 -1 4:542-53
PMID 25061554
标题 通过新重建的脑特异性代谢网络对神经退行性疾病对人脑代谢的转录水平影响的系统分析。
抽象的 面向网络的分析对于识别受给定扰动影响的细胞的那些部分至关重要。通过使用新重建的脑特异性代谢网络研究了神经退行性扰动以脑代谢疾病形式的影响。开发的化学计量模型正确地代表了健康的脑代谢,并包括星形胶质细胞和神经元之间的630个代谢反应,这些反应由570个基因控制。六种神经退行性疾病的转录组数据(阿尔茨海默氏病,帕金森氏病,亨廷顿氏病,肌萎缩性侧面硬化症,多发性硬化症,多发性硬化症,精神分裂症)进行模型以识别这些疾病特定和常见的记者特征,该特征揭示了发生最重要变化的代谢物和途径。确定的代谢产物是相关疾病病理学的潜在生物标志物。我们的模型表明,氧化应激,包括TCA循环和脂质代谢在内的能量代谢以及几种相关途径的扰动与这些途径在研究疾病中的作用一致。通过结合位点分析实现了通常调节报告基因代谢物的转录因子的计算预测。文献支持已确定的转录因子,例如USF1,SP1和Fox家族的人从文献中众所周知,在确定的记者代谢途径以及神经退行性疾病中具有调节作用。从本质上讲,重建的大脑模型可以阐明扰动对脑代谢的影响以及可能的机器的照明,其中特定的代谢物或途径是细胞重组的调节点。
SCZ关键字 精神分裂症
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