1 RNA Biol 2013 2月10日:192-204
PMID 23353575
标题 高通量屏幕,以识别ADAR介导的RNA编辑的增强子。
抽象的 RNA的腺苷对RNA的肌苷脱氨基在后唑广泛分布。识别识别为鸟嘌呤,因此,这种RNA编辑可以影响RNA的编码潜力,定位和稳定性。因此,RNA编辑以灵活的方式有助于转录组的多样化。编辑反应是由作用于RNA(ADARS)的腺苷脱氨酶进行的,这对于许多生物体的正常生命和发育至关重要。在开发过程中观察到编辑水平的变化,也可以在神经病理学等神经病理中观察到变化精神分裂症,抑郁或肿瘤。通常,编辑水平的变化不会反映出ADAR水平的变化表明调节酶活性。到目前为止,只有少数因素才会影响ADAR的活性。在这里,我们提出了一个两阶段的体内编辑屏幕,旨在隔离编辑器的增强器。将主要的高通量酵母屏幕与哺乳动物细胞中更准确的二级筛选结合在一起,该筛选使用荧光读数来检测RNA编辑中的较小差异。屏幕已成功地用于识别DSS1/SHFM1,RNA结合蛋白HNRNP A2/B1和3'UTR作为编辑器。通过改变细胞内DSS1/SHFM1级别,我们可以调整A到我的编辑高达30%。蛋白质组学分析表明DSS1/SHFM1HNRNP A2/B1表明这两个因素都可以通过改变细胞RNP景观来起作用。该屏幕从不同组织或发育阶段扩展到cDNA可能被证明可用于识别其他RNA编辑的增强子。
SCZ关键字 精神分裂症
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