| 1 | 药物基因组学2011年2月12日：171-84 |
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| PMID | 21332311 |
| 标题 | 人淋巴母细胞系的全基因组表达分析将CHL1鉴定为推定的SSRI抗抑郁反应生物标志物。 |
| 抽象的 | 选择性5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRIS）是治疗严重抑郁症的最常用类抗抑郁药。但是，大约30％的患者对一线抗抑郁药治疗的反应不足，需要替代治疗剂。到目前为止，搜索SSRI反应DNA生物标志物或候选5-羟色胺相关基因的研究的全基因组研究尚无定论或矛盾的结果。在这里，我们提出了一种基于转录组的替代基因组范围的方法，用于通过在人淋巴母细胞系（LCLS）中使用药物效应表型来搜索抗抑郁药物反应生物标志物。 我们从健康的成年女性中筛选了80个LCL，以通过paroxetine抑制生长。共选择14个对帕罗西汀（每个表型组的7）具有可再现的高和低敏感性的LCL，以使用商业微阵列进行全基因组表达分析。 表现出较高的LCL与低帕罗西汀敏感性之间的最显着的全基因组转录组差异是CHL1的基础表达低6.3倍（P = 0.0000256），该基因是编码在正确的丘脑皮层回路中的神经元细胞粘附蛋白的基因，该基因编码为神经元细胞粘附蛋白，精神分裂症和自闭症。通过实时PCR（高帕罗西汀敏感性组中CHL1表达水平较低36倍）证实了微阵列的发现。与突触发生或精神疾病有关的其他基因，包括ARRB1，CCL5，DDX60，DDX60L，endod1，enpp2，flt1，gabra4，gap43，mctp2和spry2，在两个paroxetine敏感性组之间也差异超过1.5倍，p值小于0.005，如实时PCR实验所证实。 全基因组全基因组的转录分析鉴定出CHL1和与突触发生和脑电路有关的其他基因作为推定的SSRI反应生物标志物。该方法可以用作寻找潜在抑郁症治疗生物标志物的初步工具。 |
| SCZ关键字 | 精神分裂症 |