肺动脉高血压知识库(bioinfom_tsdb)
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肺动脉高血压知识库
一般信息|文学|表达式|监管|变体|交互

基本信息

基因身份证

10078年

的名字

TSSC4

同义的

肿瘤抑制subtransferable候选人4;TSSC4;肿瘤抑制subtransferable候选人4

定义

肿瘤抑制底座cDNA 4蛋白质蛋白质TSSC4 | |肿瘤抑制subchromosomal转移片段候选基因4蛋白

位置

11 p15.5

基因型

蛋白质编码

突变简介:

 域的突变
在17个主要癌症突变模式
LoF vs错义突变
数据库V72宇宙的所有拷贝数变化
宇宙的所有突变数据库V72

突变总结蛋白质域

前
我们使用从合奏BioMart uniprot蛋白质结构数据的数据库。圆的大小显示了相对变异数。

非同义(上)和(底部)同义突变比例对各种癌症

前
非同义突变模式在17个主要的癌症类型。
同义突变模式在17个主要的癌症类型。

损失函数的突变与错义突变

前
损失函数的突变比较错义突变。
丧失突变在错义突变的比例是0.00。

各种癌症的拷贝数变化

前
拷贝数变化的17个主要癌症组:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; NS, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

拷贝数变化的17个主要的癌症类型:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; Not specific, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

宇宙体细胞突变(最高)

突变(cd;AA;科)

网站

组织学

突变类型

c.609G >;p.Q203Q;11:2403242 - 2403242

 胃 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.621C > G;p.S207R;11:2403254 - 2403254

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤 替换-错义

c.889C > T;p.P297S;11:2403522 - 2403522

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.349A > C;p.S117R;11:2402982 - 2402982

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.658C > T;p.R220 *;11:2403291 - 2403291

 骨 Ewings_sarcoma-peripheral_primitive_neuroectodermal_tumour 替换-胡说

c.623G >;p.C208Y;11:2403256 - 2403256

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-错义

c.228G >;p.T76T;11:2402861 - 2402861

 胃 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.864C > T;p.V288V;11:2403497 - 2403497

 乳房 癌 替换-编码沉默

c.970G >;p.D324N;11:2403603 - 2403603

 胰腺 癌 替换-错义

c.666C > T;p.V222V;11:2403299 - 2403299

 皮肤 malignant_melanoma 替换-编码沉默

c.898G > T;p.E300 *;11:2403531 - 2403531

 皮肤 malignant_melanoma 替换-胡说

c.274C > T;p.R92C;11:2402907 - 2402907

 large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.274C > T;p.R92C;11:2402907 - 2402907

 large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.924G > C;p.R308S;11:2403557 - 2403557

 乳房 癌 替换-错义

c.481C > T;p.R161C;11:2403114 - 2403114

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.478G >;p.E160K;11:2403111 - 2403111

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.357C > T;p.N119N;11:2402990 - 2402990

 胃 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.322C > T;p.P108S;11:2402955 - 2402955

 皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.269C > T;p.S90F;11:2402902 - 2402902

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.549G > T;p.L183L;11:2403182 - 2403182

 肺 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.617C > G;p.S206C;11:2403250 - 2403250

 肺 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.820C > T;p.H274Y;11:2403453 - 2403453

 皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.597C > T;p.S199S;11:2403230 - 2403230

 皮肤 malignant_melanoma 替换-编码沉默

c.168G > T;p.G56G;11:2402801 - 2402801

 胰腺 癌 替换-编码沉默

c.904G >;p.V302I;11:2403537 - 2403537

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.46G >;p.E16K;11:2402679 - 2402679

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.784G >;p.G262R;11:2403417 - 2403417

 甲状腺 其他;肿瘤 替换-错义

c.946C > G;p.R316G;11:2403579 - 2403579

 骨 Ewings_sarcoma-peripheral_primitive_neuroectodermal_tumour 替换-错义

c.423T >;p.H141Q;11:2403056 - 2403056

 肺 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.630G >;p.E210E;11:2403263 - 2403263

 皮肤 malignant_melanoma 替换-编码沉默

c.356A > G;p.N119S;11:2402989 - 2402989

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.45C > T;p.G15G;11:2402678 - 2402678

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-编码沉默

c.751G > T;p.G251C;11:2403384 - 2403384

 肝 癌 替换-错义

c.751G > T;p.G251C;11:2403384 - 2403384

 肝 癌 替换-错义

c.730G > T;p.G244W;11:2403363 - 2403363

 肺 癌;non_small_cell_carcinoma 替换-错义

c.543C > T;p.T181T;11:2403176 - 2403176

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-编码沉默

c.543C > T;p.T181T;11:2403176 - 2403176

 胃 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.497G > T;p.S166I;11:2403130 - 2403130

 肺 癌;腺癌 替换-错义

c.482G >;p.R161H;11:2403115 - 2403115

 肺 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.477C > T;p.P159P;11:2403110 - 2403110

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-编码沉默

c.514G >;p.E172K;11:2403147 - 2403147

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

”)
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