肺动脉高血压知识库(bioinfom_tsdb)
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肺动脉高血压知识库
一般信息|文学|表达式|监管|变体|交互

基本信息

基因身份证

112464年

的名字

PRKCDBP

同义的

蛋白激酶C,三角洲结合蛋白;PRKCDBP;蛋白激酶C,δ结合蛋白

定义

蛋白激酶C delta-binding蛋白| sdr-related基因产品,结合c-kinase |血清剥夺响应factor-related c-kinase结合基因产物

位置

11 p15.4

基因型

蛋白质编码

突变简介:

 域的突变
在17个主要癌症突变模式
LoF vs错义突变
数据库V72宇宙的所有拷贝数变化
宇宙的所有突变数据库V72

突变总结蛋白质域

前
我们使用从合奏BioMart uniprot蛋白质结构数据的数据库。圆的大小显示了相对变异数。

非同义(上)和(底部)同义突变比例对各种癌症

前
非同义突变模式在17个主要的癌症类型。
同义突变模式在17个主要的癌症类型。

损失函数的突变与错义突变

前
损失函数的突变比较错义突变。
丧失突变在错义突变的比例是0.10。

各种癌症的拷贝数变化

前
拷贝数变化的17个主要癌症组:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; NS, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

拷贝数变化的17个主要的癌症类型:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; Not specific, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

宇宙体细胞突变(最高)

突变(cd;AA;科)

网站

组织学

突变类型

c.409G >;p.A137T;11:6319540 - 6319540

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.409G >;p.A137T;11:6319540 - 6319540

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.384 + 10 c > T;p。?。11:6320083 - 6320083

 前列腺癌 癌 未知的

c.200T >;p.L67Q;11:6320277 - 6320277

 乳房 癌 替换-错义

c.53delG;p.G18fs * 6;11:6320424 - 6320424

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 删除——转移

c.25G >;p.G9R;11:6320452 - 6320452

 胃 癌;腺癌 替换-错义

c.565C >;p.L189I;11:6319384 - 6319384

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.342G >;p.G114G;11:6320135 - 6320135

 乳房 癌 替换-编码沉默

c.539G >;p.R180H;11:6319410 - 6319410

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.539G >;p.R180H;11:6319410 - 6319410

 胃 癌;intestinal_adenocarcinoma 替换-错义

c.581C > T;p.S194L;11:6319368 - 6319368

 urinary_tract;膀胱 癌;transitional_cell_carcinoma 替换-错义

c.581C > T;p.S194L;11:6319368 - 6319368

 urinary_tract;膀胱 癌 替换-错义

c.581C > T;p.S194L;11:6319368 - 6319368

 upper_aerodigestive_tract;咽 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.608C > T;p.P203L;11:6319341 - 6319341

 胃 癌;腺癌 替换-错义

c.34C > T;p.P12S;11:6320443 - 6320443

 urinary_tract;膀胱 癌 替换-错义

c.681G >;p.A227A;11:6319268 - 6319268

 胃 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.106C > T;p.L36L;11:6320371 - 6320371

 肺 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.432C >;p.P144P;11:6319517 - 6319517

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.389_391delAGG;p.E130delE;11:6319558 - 6319560

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 删除——在坐标系

c.654T >;p.A218A;11:6319295 - 6319295

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.654T >;p.A218A;11:6319295 - 6319295

 胰腺 癌;ductal_carcinoma 替换-编码沉默

c.654T >;p.A218A;11:6319295 - 6319295

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.654T >;p.A218A;11:6319295 - 6319295

 甲状腺 其他;肿瘤 替换-编码沉默

c.456G >;p.E152E;11:6319493 - 6319493

 骨;胫骨 Ewings_sarcoma-peripheral_primitive_neuroectodermal_tumour 替换-编码沉默

c.606A > T;p.P202P;11:6319343 - 6319343

 肺 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.139G >;p.A47T;11:6320338 - 6320338

 large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.680C > T;p.A227V;11:6319269 - 6319269

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-错义

c.438C > G;p.G146G;11:6319511 - 6319511

 肺 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.689C >;p.P230H;11:6319260 - 6319260

 胃 癌;腺癌 替换-错义

c.618G >;p.P206P;11:6319331 - 6319331

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.367C > T;p.H123Y;11:6320110 - 6320110

 肺;right_lower_lobe 癌;腺癌 替换-错义

c.466G >;p.E156K;11:6319483 - 6319483

 皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.720C > T;p.T240T;11:6319229 - 6319229

 乳房 癌 替换-编码沉默

c.473T > C;p.L158P;11:6319476 - 6319476

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-错义

c.473T > C;p.L158P;11:6319476 - 6319476

 乳房 癌 替换-错义

c.473T > C;p.L158P;11:6319476 - 6319476

 甲状腺 其他;肿瘤 替换-错义

c.473T > C;p.L158P;11:6319476 - 6319476

 urinary_tract;膀胱 癌;transitional_cell_carcinoma 替换-错义

c.437G > T;p.G146V;11:6319512 - 6319512

 肺 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.448C > T;p.Q150 *;11:6319501 - 6319501

 肺 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-胡说

”)
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