肺动脉高血压知识库(bioinfom_tsdb)
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肺动脉高血压知识库
一般信息|文学|表达式|监管|变体|交互

基本信息

基因身份证

3248年

的名字

HPGD

同义的

hydroxyprostaglandin脱氢酶15 - (NAD); HPGD hydroxyprostaglandin脱氢酶15 - (NAD)

定义

15-hydroxyprostaglandin脱氢酶(NAD (+)) | NAD +端依赖15-hydroxyprostaglandin脱氢酶|前列腺素脱氢酶1 |短链脱氢酶/ 36 c还原酶家族成员1 |短链脱氢酶/ 36 c还原酶家族,成员1

位置

4 q34-q35

基因型

蛋白质编码

突变简介:

 域的突变
在17个主要癌症突变模式
LoF vs错义突变
数据库V72宇宙的所有拷贝数变化
宇宙的所有突变数据库V72

突变总结蛋白质域

前
我们使用从合奏BioMart uniprot蛋白质结构数据的数据库。圆的大小显示了相对变异数。

非同义(上)和(底部)同义突变比例对各种癌症

前
非同义突变模式在17个主要的癌症类型。
同义突变模式在17个主要的癌症类型。

损失函数的突变与错义突变

前
损失函数的突变比较错义突变。
丧失突变在错义突变的比例是0.00。

各种癌症的拷贝数变化

前
拷贝数变化的17个主要癌症组:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; NS, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

拷贝数变化的17个主要的癌症类型:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; Not specific, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

宇宙体细胞突变(最高)

突变(cd;AA;科)

网站

组织学

突变类型

c.462A > G;p.S154S;4:174495584 - 174495584

 胃 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.442C >;p.Q148K;4:174495604 - 174495604

 卵巢 其他;肿瘤 替换-错义

c.222T > G;p.T74T;4:174518073 - 174518073

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.494C > T;p.A165V;4:174495552 - 174495552

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue lymphoid_neoplasm;NK-T_cell_lymphoma 替换-错义

c.275C >;p.A92D;4:174518020 - 174518020

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.60C > G;p.A20A;4:174522392 - 174522392

 前列腺癌 癌 替换-编码沉默

c.402C > T;p.I134I;4:174508715 - 174508715

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.748G >;p.G250R;4:174492009 - 174492009

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.672G >;p.L224L;4:174492085 - 174492085

 皮肤 malignant_melanoma 替换-编码沉默

c.526G >;p.V176M;4:174493287 - 174493287

 肺;right_upper_lobe 癌;腺癌 替换-错义

c.157T > G;p.F53V;4:174522004 - 174522004

 皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.156G >;p.Q52Q;4:174522005 - 174522005

 前列腺癌 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.207A > G;p.Q69Q;4:174521954 - 174521954

 肺 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.156G > C;p.Q52H;4:174522005 - 174522005

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;acute_myeloid_leukaemia 替换-错义

c.706G > C;p.D236H;4:174492051 - 174492051

 soft_tissue;blood_vessel 血管肉瘤 替换-错义

c.283A > T;p.N95Y;4:174518012 - 174518012

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-错义

c.743C >;p.S248Y;4:174492014 - 174492014

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.497C > T;p.A166V;4:174495549 - 174495549

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.788C > G;p.A263G;4:174491969 - 174491969

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.512T > G;p.L171R;4:174493301 - 174493301

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue;脾 lymphoid_neoplasm;marginal_zone_lymphoma 替换-错义

c.498 + 1 g >;p。?。4:174495547 - 174495547

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 未知的

c.625C >;p.H209N;4:174493188 - 174493188

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.493G > T;p.A165S;4:174495553 - 174495553

 肺 癌;腺癌 替换-错义

c.718G > T;p.G240C;4:174492039 - 174492039

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.498G > T;p.A166A;4:174495548 - 174495548

 前列腺癌 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.746A > G;p.K249R;4:174492011 - 174492011

 肺 癌;腺癌 替换-错义

c.645A > G;p.K215K;4:174493168 - 174493168

 肺 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.682G >;p.G228R;4:174492075 - 174492075

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.94-1G > T;p。?。4:174522068 - 174522068

 肾脏 癌;clear_cell_renal_cell_carcinoma 未知的

c.391G >;p.G131S;4:174508726 - 174508726

 urinary_tract;膀胱 癌 替换-错义

c.694C > T;p.L232F;4:174492063 - 174492063

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.487C > T;p.R163C;4:174495559 - 174495559

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-错义

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