肺动脉高血压知识库(bioinfom_tsdb)
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肺动脉高血压知识库
一般信息|文学|表达式|监管|变体|交互

基本信息

基因身份证

3659年

的名字

IRF1

同义的

干扰素调节因子1;IRF1;干扰素调节因子1

定义

干扰素调节因子1同种型+ 19 |干扰素调节因子1同种型d78 |干扰素调节因子1同种型delta4 | delta7干扰素调节因子1对碘氧基苯甲醚

位置

5 q31.1

基因型

蛋白质编码

突变简介:

域的突变
在17个主要癌症突变模式
LoF vs错义突变
数据库V72宇宙的所有拷贝数变化
宇宙的所有突变数据库V72

突变总结蛋白质域

我们使用从合奏BioMart uniprot蛋白质结构数据的数据库。圆的大小显示了相对变异数。

非同义(上)和(底部)同义突变比例对各种癌症

非同义突变模式在17个主要的癌症类型。
同义突变模式在17个主要的癌症类型。

损失函数的突变与错义突变

损失函数的突变比较错义突变。
丧失突变在错义突变的比例是0.28

各种癌症的拷贝数变化

拷贝数变化的17个主要癌症组:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; NS, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

拷贝数变化的17个主要的癌症类型:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; Not specific, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

宇宙体细胞突变(最高)

突变(cd;AA;科)

网站

组织学

突变类型

c.811_812insG;p.D271fs * 3;5:132484403 - 132484404

插入——转移

c.60A > C;p.Q20H;5:132489419 - 132489419

large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.158G >;p.C53Y;5:132487955 - 132487955

乳房 替换-错义

c.921C > T;p.D307D;5:132484008 - 132484008

肾脏 癌;clear_cell_renal_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.357G > C;p.Q119H;5:132486961 - 132486961

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic_syndrome 替换-错义

c.357G > C;p.Q119H;5:132486961 - 132486961

癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.197A > G;p.K66R;5:132487121 - 132487121

肾脏 癌;clear_cell_renal_cell_carcinoma 替换-错义

c.311C >;p.S104 *;5:132487007 - 132487007

癌;腺癌 替换-胡说

c.932C > T;p.T311I;5:132483997 - 132483997

皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.765delG;p.Y256fs * 34;5:132484450 - 132484450

large_intestine;结肠 癌;腺癌 删除——转移

c.244C > T;p.R82C;5:132487074 - 132487074

癌;腺癌 替换-错义

c.3G >;p.M1I;5:132489476 - 132489476

食管 癌;腺癌 替换-错义

c.554C > T;p.P185L;5:132486364 - 132486364

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic_syndrome 替换-错义

c.53C >;p.S18Y;5:132489426 - 132489426

haematopoietic_and_lymphoid_tissue;lymph_node lymphoid_neoplasm;diffuse_large_B_cell_lymphoma 替换-错义

c.498_499insA;p.P167fs * 42;5:132486602 - 132486603

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic_syndrome 插入——转移

c.665A > C;p.E222A;5:132486253 - 132486253

large_intestine;直肠 癌;腺癌 替换-错义

c.129G >;p.K43K;5:132487984 - 132487984

癌;腺癌 替换-编码沉默

c.326A > G;p.Y109C;5:132486992 - 132486992

large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.618_630del13;p.S207fs * 28;5:132486288 - 132486300

食管 癌;腺癌 删除——转移

c.593C > T;p.P198L;5:132486325 - 132486325

甲状腺 替换-错义

c.235G >;p.A79T;5:132487083 - 132487083

large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.151G >;p.D51N;5:132487962 - 132487962

皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.800C > T;p.S267F;5:132484415 - 132484415

urinary_tract;膀胱 替换-错义

c.674C > T;p.T225I;5:132485710 - 132485710

central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-错义

c.800C > T;p.S267F;5:132484415 - 132484415

urinary_tract;膀胱 替换-错义

c.800C > T;p.S267F;5:132484415 - 132484415

urinary_tract;膀胱 癌;transitional_cell_carcinoma 替换-错义

c.193_194insA;p.Y65fs * 1;5:132487124 - 132487125

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic_syndrome 插入——转移

c.195C >;p.Y65 *;5:132487123 - 132487123

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic_syndrome 替换-胡说

c.78G > T;p.W26C;5:132489401 - 132489401

甲状腺 其他;肿瘤 替换-错义

c.256A > C;p.N86H;5:132487062 - 132487062

前列腺癌 替换-错义

c.568A > T;p.S190C;5:132486350 - 132486350

癌;腺癌 替换-错义

c.757G > C;p.G253R;5:132484458 - 132484458

large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.750C > T;p.N250N;5:132484465 - 132484465

large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.43C > T;p.Q15 *;5:132489436 - 132489436

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic-myeloproliferative_neoplasm-unclassifiable 替换-胡说

c.454C > T;p.L152F;5:132486647 - 132486647

乳房 替换-错义

c.965C >;p.P322H;5:132483964 - 132483964

癌;腺癌 替换-错义

c.667G > C;p.A223P;5:132486251 - 132486251

子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.733G >;p.E245K;5:132484482 - 132484482

large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.239A > G;p.N80S;5:132487079 - 132487079

large_intestine;直肠 癌;腺癌 替换-错义

c.385C > T;p.R129 *;5:132486824 - 132486824

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic_syndrome 替换-胡说

c.220C > G;p.P74A;5:132487098 - 132487098

乳房 替换-错义

c.217G > C;p.D73H;5:132487101 - 132487101

癌;腺癌 替换-错义

c.187G >;p.G63S;5:132487926 - 132487926

胰腺 替换-错义

c.491A > G;p.Y164C;5:132486610 - 132486610

骨;骨盆 软骨肉瘤 替换-错义

c.908_909CC TT >;p.A303V;5:132484020 - 132484021

皮肤;的脸 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.718-2A > G;p。?。5:132484499 - 132484499

large_intestine;结肠 癌;腺癌 未知的

c.328C >;p.R110R;5:132486990 - 132486990

子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-编码沉默

c.687G >;p.E229E;5:132485697 - 132485697

肾脏 癌;clear_cell_renal_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.179T > G;p.I60S;5:132487934 - 132487934

haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;myelodysplastic_syndrome 替换-错义

c.444C > T;p.F148F;5:132486657 - 132486657

皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.718-1G > T;p。?。5:132484498 - 132484498

large_intestine;盲肠 癌;腺癌 未知的

c.33G >;p.W11 *;5:132489446 - 132489446

haematopoietic_and_lymphoid_tissue lymphoid_neoplasm;diffuse_large_B_cell_lymphoma 替换-胡说

c.785G > T;p.G262V;5:132484430 - 132484430

癌;intestinal_adenocarcinoma 替换-错义

c.954C > G;p.I318M;5:132483975 - 132483975

urinary_tract;膀胱 替换-错义

c.975G >;p.P325P;5:132483954 - 132483954

前列腺癌 替换-编码沉默


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