肺动脉高血压知识库(bioinfom_tsdb)
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肺动脉高血压知识库
一般信息|文学|表达式|监管|变体|交互

基本信息

基因身份证

8742年

的名字

TNFSF12

同义的

肿瘤坏死因子(配体)总科,成员12;TNFSF12;肿瘤坏死因子(配体)总科,12个成员

定义

APO3配体| APO3 / DR3配体| TNF-related弱凋亡的诱导物|肿瘤坏死因子配体超家族成员12

位置

17 p13

基因型

蛋白质编码

突变简介:

 域的突变
在17个主要癌症突变模式
LoF vs错义突变
数据库V72宇宙的所有拷贝数变化
宇宙的所有突变数据库V72

突变总结蛋白质域

前
我们使用从合奏BioMart uniprot蛋白质结构数据的数据库。圆的大小显示了相对变异数。

非同义(上)和(底部)同义突变比例对各种癌症

前
非同义突变模式在17个主要的癌症类型。
同义突变模式在17个主要的癌症类型。

损失函数的突变与错义突变

前
损失函数的突变比较错义突变。
丧失突变在错义突变的比例是0.06。

各种癌症的拷贝数变化

前
拷贝数变化的17个主要癌症组:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; NS, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

拷贝数变化的17个主要的癌症类型:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; Not specific, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

宇宙体细胞突变(最高)

突变(cd;AA;科)

网站

组织学

突变类型

c.268C > T;p.R90W;17:7550180 - 7550180

 乳房 癌 替换-错义

c.414C > G;p.I138M;17:7556818 - 7556818

 乳房 癌 替换-错义

c.269G >;p.R90Q;17:7550181 - 7550181

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.234C >;p.S78R;17:7550146 - 7550146

 autonomic_ganglia 神经母细胞瘤 替换-错义

c.569G > C;p.R190P;17:7557169 - 7557169

 前列腺癌 癌;腺癌 替换-错义

c.568C > T;p.R190C;17:7557168 - 7557168

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.374-5T > C;p。?。17:7556773 - 7556773

 卵巢 其他;肿瘤 未知的

c.392G >;p.S131N;17:7556796 - 7556796

 肾脏 癌;clear_cell_renal_cell_carcinoma 替换-错义

c.720C >;p.L240L;17:7557320 - 7557320

 urinary_tract;膀胱 癌 替换-编码沉默

c.674G >;p.R225Q;17:7557274 - 7557274

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.438C > T;p.Y146Y;17:7556842 - 7556842

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.401A > G;p.E134G;17:7556805 - 7556805

 乳房 癌 替换-错义

c.707C > T;p.A236V;17:7557307 - 7557307

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.425G >;p.S142N;17:7556829 - 7556829

 皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.289A > T;p.K97 *;17:7550804 - 7550804

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-胡说

c.743T > C;p.V248A;17:7557343 - 7557343

 前列腺癌 癌 替换-错义

c.347G >;p.R116Q;17:7550952 - 7550952

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.219C > T;p.P73P;17:7550131 - 7550131

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.488T > C;p.L163P;17:7556892 - 7556892

 large_intestine;结肠 癌 替换-错义

c.640G >;p.G214S;17:7557240 - 7557240

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.730G >;p.G244R;17:7557330 - 7557330

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.516G >;p.G172G;17:7557116 - 7557116

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 肝 癌;hepatocellular_carcinoma 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 upper_aerodigestive_tract;口 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 肝 癌;hepatocellular_carcinoma 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;acute_myeloid_leukaemia 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 肝 癌;hepatocellular_carcinoma 替换-编码沉默

c.600G > C;p.A200A;17:7557200 - 7557200

 甲状腺 其他;肿瘤 替换-编码沉默

c.569G >;p.R190H;17:7557169 - 7557169

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.623G >;p.R208H;17:7557223 - 7557223

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-错义

c.697C >;p.H233N;17:7557297 - 7557297

 large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.514G >;p.G172R;17:7557114 - 7557114

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.276C >;p.R92R;17:7550188 - 7550188

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.276C >;p.R92R;17:7550188 - 7550188

 甲状腺 其他;肿瘤 替换-编码沉默

c.202C > G;p.P68A;17:7549516 - 7549516

 central_nervous_system;大脑 primitive_neuroectodermal_tumour-medulloblastoma 替换-错义

”)
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