肺动脉高血压知识库(bioinfom_tsdb)
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肺动脉高血压知识库
一般信息|文学|表达式|监管|变体|交互

基本信息

基因身份证

8744年

的名字

TNFSF9

同义的

肿瘤坏死因子(配体)总科,成员9;TNFSF9;肿瘤坏死因子(配体)总科,成员9

定义

4-1BB配体| 4-1BBL |同族体鼠标4-1BB-L | 4-1BB受体配体|肿瘤坏死因子配体超家族成员9

位置

19 p13.3

基因型

蛋白质编码

突变简介:

 域的突变
在17个主要癌症突变模式
LoF vs错义突变
数据库V72宇宙的所有拷贝数变化
宇宙的所有突变数据库V72

突变总结蛋白质域

前
我们使用从合奏BioMart uniprot蛋白质结构数据的数据库。圆的大小显示了相对变异数。

非同义(上)和(底部)同义突变比例对各种癌症

前
非同义突变模式在17个主要的癌症类型。
同义突变模式在17个主要的癌症类型。

损失函数的突变与错义突变

前
损失函数的突变比较错义突变。
丧失突变在错义突变的比例是0.12。

各种癌症的拷贝数变化

前
拷贝数变化的17个主要癌症组:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; NS, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

拷贝数变化的17个主要的癌症类型:1;乳腺癌、2;中枢神经系统,3;子宫颈,4;子宫内膜,5;lymphoid_tissue造血,6;肾脏,7;大肠,8;肝脏,9;肺癌、10; Not specific, 11; Ovary, 12; Pancreas, 13; Prostate, 14; Skin, 15; Stomach, 16; Thyroid, 17; Urinary tract

宇宙体细胞突变(最高)

突变(cd;AA;科)

网站

组织学

突变类型

c.727G >;p.E243K;19:6535028 - 6535028

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.316C > T;p.P106S;19:6534617 - 6534617

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.715C > T;p.R239W;19:6535016 - 6535016

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.347C > T;p.A116V;19:6534648 - 6534648

 large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.642C > T;p.V214V;19:6534943 - 6534943

 皮肤 malignant_melanoma 替换-编码沉默

c.716G >;p.R239Q;19:6535017 - 6535017

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.512G >;p.R171H;19:6534813 - 6534813

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.504G > T;p.Q168H;19:6534805 - 6534805

 upper_aerodigestive_tract;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.504G > T;p.Q168H;19:6534805 - 6534805

 upper_aerodigestive_tract;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.504G > T;p.Q168H;19:6534805 - 6534805

 upper_aerodigestive_tract;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.504G > T;p.Q168H;19:6534805 - 6534805

 upper_aerodigestive_tract;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.562G >;p.A188T;19:6534863 - 6534863

 soft_tissue;blood_vessel 血管肉瘤 替换-错义

c.591C > G;p.F197L;19:6534892 - 6534892

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.711C > T;p.L237L;19:6535012 - 6535012

 肝 癌 替换-编码沉默

c.745C > T;p.P249S;19:6535046 - 6535046

 皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.745C > T;p.P249S;19:6535046 - 6535046

 皮肤 malignant_melanoma 替换-错义

c.669C >;p.R223R;19:6534970 - 6534970

 urinary_tract;膀胱 癌 替换-编码沉默

c.669C >;p.R223R;19:6534970 - 6534970

 urinary_tract;膀胱 癌;transitional_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.727G > C;p.E243Q;19:6535028 - 6535028

 肺 癌;腺癌 替换-错义

c.150C >;p.A50A;19:6531186 - 6531186

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.752C > T;p.P251L;19:6535053 - 6535053

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-错义

c.71G >;p.C24Y;19:6531107 - 6531107

 urinary_tract;膀胱 癌;transitional_cell_carcinoma 替换-错义

c.739G > T;p.G247 *;19:6535040 - 6535040

 肺 癌;腺癌 替换-胡说

c.591C > T;p.F197F;19:6534892 - 6534892

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue haematopoietic_neoplasm;acute_myeloid_leukaemia 替换-编码沉默

c.343C >;p.L115M;19:6534644 - 6534644

 large_intestine 癌;腺癌 替换-错义

c.521C >;p.A174D;19:6534822 - 6534822

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.759G >;p.S253S;19:6535060 - 6535060

 胃 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.759G >;p.S253S;19:6535060 - 6535060

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue lymphoid_neoplasm;chronic_lymphocytic_leukaemia-small_lymphocytic_lymphoma 替换-编码沉默

c.3G >;p.M1I;19:6531039 - 6531039

 皮肤;的脸 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.732C > T;p.I244I;19:6535033 - 6535033

 皮肤 malignant_melanoma 替换-编码沉默

c.310G > C;p.D104H;19:6534611 - 6534611

 upper_aerodigestive_tract;口 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.690G >;p.Q230Q;19:6534991 - 6534991

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.390G >;p.T130T;19:6534691 - 6534691

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-编码沉默

c.638G >;p.G213D;19:6534939 - 6534939

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.400G >;p.V134M;19:6534701 - 6534701

 肾脏 癌;clear_cell_renal_cell_carcinoma 替换-错义

c.102_107delGCTGCT;p.L40_L41delLL;19:6531138 - 6531143

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue lymphoid_neoplasm;angioimmunoblastic_T_cell_lymphoma 删除——在坐标系

c.58C > T;p.R20C;19:6531094 - 6531094

 食道;lower_third 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-错义

c.389C > T;p.T130M;19:6534690 - 6534690

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.18C > T;p.D6D;19:6531054 - 6531054

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-编码沉默

c.578G >;p.R193Q;19:6534879 - 6534879

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.357C > T;p.S119S;19:6534658 - 6534658

 皮肤 malignant_melanoma 替换-编码沉默

c.123C > T;p.L41L;19:6531159 - 6531159

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 替换-编码沉默

c.418G >;p.V140I;19:6534719 - 6534719

 子宫内膜 癌;endometrioid_carcinoma 替换-错义

c.694G >;p.A232T;19:6534995 - 6534995

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-错义

c.694G >;p.A232T;19:6534995 - 6534995

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-错义

c.451C > T;p.R151C;19:6534752 - 6534752

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 替换-错义

c.363delG;p.G123fs * 2;19:6534664 - 6534664

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 删除——转移

c.370C > G;p.L124V;19:6534671 - 6534671

 卵巢 癌;serous_carcinoma 替换-错义

c.693C > T;p.G231G;19:6534994 - 6534994

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-编码沉默

c.693C > T;p.G231G;19:6534994 - 6534994

 前列腺癌 癌 替换-编码沉默

c.267 + 2 t > C;p。?。19:6531305 - 6531305

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 未知的

c.426delT;p.Y142fs * 1;19:6534727 - 6534727

 皮肤;head_neck 癌;squamous_cell_carcinoma 删除——转移

c.591C >;p.F197L;19:6534892 - 6534892

 肝 癌 替换-错义

c.23C > T;p.S8L;19:6531059 - 6531059

 骨;胫骨 Ewings_sarcoma-peripheral_primitive_neuroectodermal_tumour 替换-错义

c.591C >;p.F197L;19:6534892 - 6534892

 肝 癌 替换-错义

c.624C > T;p.A208A;19:6534925 - 6534925

 central_nervous_system;大脑 神经胶质瘤;astrocytoma_Grade_IV 替换-编码沉默

c.102_104delGCT;p.L41delL;19:6531138 - 6531140

 large_intestine;盲肠 癌;腺癌 删除——在坐标系

c.102_104delGCT;p.L41delL;19:6531138 - 6531140

 large_intestine;结肠 癌;腺癌 删除——在坐标系

c.102_104delGCT;p.L41delL;19:6531138 - 6531140

 haematopoietic_and_lymphoid_tissue lymphoid_neoplasm;angioimmunoblastic_T_cell_lymphoma 删除——在坐标系

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