4826年

NNAT

Peg5; neuronatin NNAT; neuronatin

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20 q11.2-q12

蛋白质编码

背景:高档软组织肉瘤是一个异性基因诸多,复杂群咄咄逼人的恶性肿瘤间质分化。最近,越来越多的软组织肉瘤分类的基础上潜在的基因抽搐的改变;然而,异常的DNA甲基化在肿瘤中的作用还不是很清楚,因此,methylation-based分类的有效性尚不清楚。结果:我们使用了英飞纳姆HumanMethylation27平台概要DNA甲基化在80年小学,未经处理的高档软组织肉瘤,代表八个相关的子类型,两个non-neoplastic脂肪肉瘤细胞系和14个代表样品。主样本划分为七个稳定的集群。分类算法确定了216 CpG网站,映射到246基因年代,表现出不同程度的DNA甲基化在这7组。集群之间的差异是最好由一组八个位于CpG网站基因年代SPEG、NNAT FBLN2、PYROXD2 ZNF217, COL14A1, DMRT2 CDKN2A。通过整合DNA甲基化和信使rna表达式数据,我们发现27基因年代表现出消极和三个基因年代显示正相关。与non-neoplastic脂肪相比,NNAT显示DNA hypomethylation和逆基因表达式在黏液样脂肪肉瘤和DNA甲基化和逆基因表达式在肉瘤和多形性脂肪肉瘤。复苏的NNAT hypermethylated黏液样脂肪肉瘤细胞系细胞迁移和生存能力下降。结论:我们的分析是第一个全面的DNA甲基化和转录数据集成主要高档软组织肉瘤。我们提出新的生物标志物基因年代有关patho基因姐姐,包括NNAT潜力肿瘤抑制或在黏液样脂肪肉瘤。