协议和指南
流式细胞术和细胞分选良好的实践
- 总是遵循安全指导方针
- 总是在使用前验证您的抗体
- 用滴定法测量你的抗体(和其他试剂)最大化的解决你的染色
- 验证特异性你的抗体
- 块Fc受体和dye-mediated绑定当可适用
- 优化PMT电压分析性能最大化
- 包括可行性染料在你的实验。
- 每次都包括所有相关的控制
实验基本指示和建议
- 所需的细胞数量
你应该总是首先确定阳性细胞的数量在你最不频繁的细胞群,你要分析(或类),然后再计算从那里估计试验所需的原始材料。如果您感兴趣的稀少人口的期望频率如1 1000年(0.1%)和你想要100年积极事件门然后你需要分析至少100000细胞。
但注意,你可能失去了一些细胞染色的协议和部分样本体积无法分析(~ 100µL仪表/管死体积)所以很安全开始至少一半一百万细胞/样品,最后悬浮量不少于200µL流式细胞仪管。和你需要的相同的一百万细胞/管也给你一个污点/ FMO控制!此外,如果您正在执行单元排序考虑到排序效率有时会低至50%,一些积极的细胞“与他人一起旅行”是故意把废料箱(取决于类型设置)保证收集到的人口的纯度。所以你可能需要两倍的原始材料,如果你有困难样本与大量的碎片和总量。
- 样品制备
- 流式细胞术需要同质单一细胞悬浊液。检查样品质量(可行性)在光学显微镜下之前运行实验。样品的可见总量不应把乐器。
- 细胞团和其他聚合将堵塞仪器和打断你的实验
- 碎片和死细胞可能影响你流的速度和精度分析和纯度/恢复你的细胞类型
- 总是应变你的细胞;我们建议使用35µm过滤帽流式细胞仪管
- 高度聚集的细胞类型甚至可能需要限制在长期运行实例。
- 夏皮罗的流式细胞术第一定律:“51µm粒子堵塞50µm孔!”
- 无血清条件下,二价阳离子通过EDTA螯合治疗(1 - 5毫米)和/或DNAse(200µg /毫升)可以减少细胞聚合。
- 典型的细胞浓度是1 - 10每毫升百万细胞体积和最小推荐样品200 - 300µL
- 流式细胞术需要同质单一细胞悬浊液。检查样品质量(可行性)在光学显微镜下之前运行实验。样品的可见总量不应把乐器。
- 样品缓冲
典型的流式细胞仪缓冲区包含钙/镁免费PBS以小蛋白(有时是其他添加剂),提高细胞活力,减少非特定的染色,并避免坚持塑料表面。悬浮细胞培养基通常是不推荐的由于相对较高的自体荧光,pH缓冲在典型流条件差和存在附着力促进组件。
- 从PBS含有0.5% BSA(或1 - 2%的边后卫)和优化
- 样品管
- 细胞分析仪应该使用刚性(5毫升)聚苯乙烯管与仪器确保良好密封o形环;AriaII细胞分选仪可以使用聚苯乙烯或聚丙烯管(5毫升或15毫升)
- 下面的管子是已知的与我们的工具但也可以使用其他品牌和类型:
- 5毫升流式细胞仪管与35µm过滤帽(康宁,猫# 352235)
- 5毫升流式细胞仪管弹簧帽(康宁,猫# 352054)
- 15毫升锥形管(康宁,猫# 352096)
- 面板设计技巧
- 薪酬建议
- 单一污染控制必须的或比实际样品
- 但必须保持在线性范围内的信号
- 背景(=自体荧光)的阴性和阳性必须匹配
- 两个种群必须相似类型的细胞或珠子
- 控制和样品的荧光团必须是相同的
- 串联染料必须来自同一瓶
- 治疗控制样品(修复/烫,染色过程中,存储等。)
- 收集到足够的正面和负面的事件数量
- 热杀死细胞,诱导所需的表型,用捕捉珠子代替染色细胞等明确的积极的人口罕见的事件。
- 单一污染控制必须的或比实际样品
- 细胞分类建议
常见的排序规则:
- 喷嘴的大小应该至少5倍细胞直径
- 总事件率(包括碎片和死细胞)应不超过1/4的频率下降
我们的默认设置为所有细胞类型使用AriaII: 100µm喷嘴,20 psi压力和30千赫频率下降。通常你可以预计排序效率≥80%,纯度≥90%运行时每小时≤500万总细胞纯度使用掩码设置。- 吸样本,碎片和更快的流量通常减少排序效率和纯度的人群中恢复过来。
- 光显微镜下观察到的细胞复苏(手动计数)可能会远远低于仪器报道效率如果如下降延迟是校准,排序过程中细胞死亡(pH值和压力变化,管壁上干燥)或细胞消失在下游加工步骤(管和缓冲更改)
- 复苏的体积是3毫升(PBS)每100万个细胞
- 特殊要求我们可以加快排序过程使用70µm喷嘴(主要为淋巴细胞)或提高侧流质量使用130µm喷嘴(异常大细胞)。
外部资源
我们收集了许多外部网上流式细胞术资源包括面板的链接建设工具,技术教程,按需网络研讨会等等。
- 光谱的观众(能显示溢出)与荧光体探测器。
- BD生物科学,https://www.bdbiosciences.com/en-us/applications/beplay苹果手机能用吗research-applications/multicolor-flow-cytometry/product-selection-tools/spectrum-viewer
- Bio-Rad -https://www.bio-rad-antibodies.com/spectraviewer.html
- ThermoFisher科学- - - - - -https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/cell-analysis/labeling-chemistry/fluorescence-spectraviewer.html
- 荧光蛋白数据库,https://www.fpbase.org/spectra/
请注意,并不是所有的荧光团都包含在每一个在线工具;核心设备并不支持任何特定的产品或品牌。 - 面板构建器来查找和选择特定的抗体
我们所有的仪器在EasyPanel和FluoroFinder面板builder工具。
- 人工智能生成完整的面板与选项根据需要手动优化EasyPanel
- 手动匹配标记从一个给定的列表——荧光团FluoroFinder
- 网络协议和培训
有各种各样的网上建立实验室协议和培训视频。好好利用!
详细的实验室用于流式细胞术的协议
- ThermoFisher科学- - - - - -https://www.thermofisher.com/us/en/home/references/protocols/cell-and-tissue-analysis/flow-cytometry-protocol.html
- Bio-Rad -https://www.bio-rad-antibodies.com/flow-cytometry-protocols-procedures.html
流式细胞仪,在线教程和其他参考资料- 流式细胞术基本指南(Bio-Rad)https://www.bio-rad-antibodies.com/introduction-to-flow-cytometry.html
- 介绍流式细胞术(BD生物科学)https://www.bdbiosciences.com/en-us/support/training/e-learning-courses
- 分子探针的荧光https://www.thermofisher.com/us/en/home/life-science/cell-analysis/cell-analysis-learning-center/molecular-probes-school-of-fluorescence.html
- mac学院(Miltenyi研究)https://www.miltenyibiotec.com/US-en/resources/macs-academy/on-demand-webinars-and-tutorials.html
- 色素细胞收集的在线资源https://www.chromocyte.com/educate
- CytoU在线研讨会,https://learning.isac-net.org/
- FlowJo软件教程,https://www.flowjo.com/learn/flowjo-university/flowjo
- 普渡血细胞计数-讨论列表http://www.cyto.purdue.edu/hmarchiv/index.htm
- 专家血细胞计数博客和youtube频道https://expert.cheekyscientist.com/blog/,https://www.youtube.com/channel/UCdVW5fDLxx75nblr9NVtCTA
- 数据分析软件
我们的服务中心有专门的数据分析站在我们两的位置给你免费获取FlowJo,卡鲁扎和女主角的软件。这些和许多其他选项也可以下载自己电脑,经常用30天的免费试用。
一些主要的商业平台(30天的免费试用):
- FlowJo -https://www.flowjo.com/solutions/flowjo
- Kaluza -https://www.beckman.com/flow-cytometry/software/kaluza
- FCS表达-https://denovosoftware.com/
- Cytobank -https://www.cytobank.org/platform.html
- OMIQ -https://www.omiq.ai/
- WinList -https://www.vsh.com/products/winlist/index.asp
一些鲜为人知的选择(廉价或免费):
- 组织
- FlowTex -https://www.flowtex.org/
- 国际社会促进血细胞计数(直接督导下的https://isac-net.org/